Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
P4ha1Q60715 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,94■■■□□ 2,54
P4ha1Q60715 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
P4ha1Q60715 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
P4ha1Q60715 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
P4ha1Q60715 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
P4ha1Q60715 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
P4ha1Q60715 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
P4ha1Q60715 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
P4ha1Q60715 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
P4ha1Q60715 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
P4ha1Q60715 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,52
P4ha1Q60715 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
P4ha1Q60715 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
P4ha1Q60715 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
P4ha1Q60715 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,64■■■□□ 2,5
P4ha1Q60715 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
P4ha1Q60715 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
P4ha1Q60715 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
P4ha1Q60715 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,58■■■□□ 2,49
P4ha1Q60715 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
P4ha1Q60715 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
P4ha1Q60715 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
P4ha1Q60715 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
P4ha1Q60715 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
P4ha1Q60715 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
P4ha1Q60715 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
P4ha1Q60715 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
P4ha1Q60715 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
P4ha1Q60715 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
P4ha1Q60715 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
P4ha1Q60715 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
P4ha1Q60715 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
P4ha1Q60715 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
P4ha1Q60715 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
P4ha1Q60715 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
P4ha1Q60715 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
P4ha1Q60715 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
P4ha1Q60715 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
P4ha1Q60715 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
P4ha1Q60715 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,43
P4ha1Q60715 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
P4ha1Q60715 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
P4ha1Q60715 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
P4ha1Q60715 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
P4ha1Q60715 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
P4ha1Q60715 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,05■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
P4ha1Q60715 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
P4ha1Q60715 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
P4ha1Q60715 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
P4ha1Q60715 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
P4ha1Q60715 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
P4ha1Q60715 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
P4ha1Q60715 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
P4ha1Q60715 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
P4ha1Q60715 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
P4ha1Q60715 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
P4ha1Q60715 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
P4ha1Q60715 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,77■■■□□ 2,36
P4ha1Q60715 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
P4ha1Q60715 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
P4ha1Q60715 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
P4ha1Q60715 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
P4ha1Q60715 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
P4ha1Q60715 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
P4ha1Q60715 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
P4ha1Q60715 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
P4ha1Q60715 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
P4ha1Q60715 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
P4ha1Q60715 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
P4ha1Q60715 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
P4ha1Q60715 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
P4ha1Q60715 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
P4ha1Q60715 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
P4ha1Q60715 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
P4ha1Q60715 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
P4ha1Q60715 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
P4ha1Q60715 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
P4ha1Q60715 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
P4ha1Q60715 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
P4ha1Q60715 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
P4ha1Q60715 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
P4ha1Q60715 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
P4ha1Q60715 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
P4ha1Q60715 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
P4ha1Q60715 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
P4ha1Q60715 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
P4ha1Q60715 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
P4ha1Q60715 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
P4ha1Q60715 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
P4ha1Q60715 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
P4ha1Q60715 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
P4ha1Q60715 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms