Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ItgaeQ60677 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ItgaeQ60677 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ItgaeQ60677 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ItgaeQ60677 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ItgaeQ60677 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ItgaeQ60677 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ItgaeQ60677 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ItgaeQ60677 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ItgaeQ60677 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ItgaeQ60677 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ItgaeQ60677 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ItgaeQ60677 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ItgaeQ60677 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ItgaeQ60677 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ItgaeQ60677 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ItgaeQ60677 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ItgaeQ60677 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ItgaeQ60677 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ItgaeQ60677 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ItgaeQ60677 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ItgaeQ60677 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ItgaeQ60677 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ItgaeQ60677 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ItgaeQ60677 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ItgaeQ60677 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ItgaeQ60677 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ItgaeQ60677 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ItgaeQ60677 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ItgaeQ60677 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ItgaeQ60677 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ItgaeQ60677 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
ItgaeQ60677 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ItgaeQ60677 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ItgaeQ60677 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ItgaeQ60677 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ItgaeQ60677 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ItgaeQ60677 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ItgaeQ60677 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ItgaeQ60677 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ItgaeQ60677 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ItgaeQ60677 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ItgaeQ60677 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ItgaeQ60677 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ItgaeQ60677 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ItgaeQ60677 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ItgaeQ60677 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ItgaeQ60677 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ItgaeQ60677 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ItgaeQ60677 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ItgaeQ60677 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ItgaeQ60677 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ItgaeQ60677 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ItgaeQ60677 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ItgaeQ60677 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ItgaeQ60677 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ItgaeQ60677 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ItgaeQ60677 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ItgaeQ60677 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ItgaeQ60677 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ItgaeQ60677 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ItgaeQ60677 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ItgaeQ60677 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ItgaeQ60677 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ItgaeQ60677 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ItgaeQ60677 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ItgaeQ60677 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ItgaeQ60677 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ItgaeQ60677 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ItgaeQ60677 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ItgaeQ60677 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ItgaeQ60677 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ItgaeQ60677 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ItgaeQ60677 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ItgaeQ60677 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ItgaeQ60677 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ItgaeQ60677 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ItgaeQ60677 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ItgaeQ60677 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ItgaeQ60677 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ItgaeQ60677 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ItgaeQ60677 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ItgaeQ60677 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ItgaeQ60677 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ItgaeQ60677 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ItgaeQ60677 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ItgaeQ60677 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ItgaeQ60677 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ItgaeQ60677 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ItgaeQ60677 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ItgaeQ60677 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms