Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprnQ60673 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprnQ60673 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PtprnQ60673 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprnQ60673 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PtprnQ60673 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprnQ60673 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprnQ60673 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprnQ60673 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprnQ60673 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprnQ60673 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprnQ60673 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprnQ60673 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprnQ60673 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprnQ60673 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprnQ60673 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprnQ60673 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprnQ60673 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprnQ60673 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprnQ60673 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtprnQ60673 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtprnQ60673 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprnQ60673 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtprnQ60673 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprnQ60673 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprnQ60673 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtprnQ60673 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprnQ60673 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtprnQ60673 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtprnQ60673 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprnQ60673 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprnQ60673 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprnQ60673 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprnQ60673 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprnQ60673 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprnQ60673 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprnQ60673 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprnQ60673 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprnQ60673 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprnQ60673 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprnQ60673 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprnQ60673 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprnQ60673 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprnQ60673 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprnQ60673 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprnQ60673 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprnQ60673 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprnQ60673 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprnQ60673 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprnQ60673 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprnQ60673 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprnQ60673 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprnQ60673 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprnQ60673 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprnQ60673 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprnQ60673 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprnQ60673 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprnQ60673 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprnQ60673 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprnQ60673 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprnQ60673 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprnQ60673 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprnQ60673 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprnQ60673 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprnQ60673 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprnQ60673 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprnQ60673 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprnQ60673 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprnQ60673 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprnQ60673 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprnQ60673 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprnQ60673 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprnQ60673 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprnQ60673 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprnQ60673 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprnQ60673 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprnQ60673 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprnQ60673 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprnQ60673 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprnQ60673 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms