Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWU9

Acaca, Acetyl-CoA carboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcacaQ5SWU9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
AcacaQ5SWU9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AcacaQ5SWU9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AcacaQ5SWU9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AcacaQ5SWU9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AcacaQ5SWU9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AcacaQ5SWU9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AcacaQ5SWU9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AcacaQ5SWU9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AcacaQ5SWU9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AcacaQ5SWU9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AcacaQ5SWU9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AcacaQ5SWU9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AcacaQ5SWU9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AcacaQ5SWU9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AcacaQ5SWU9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AcacaQ5SWU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AcacaQ5SWU9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AcacaQ5SWU9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AcacaQ5SWU9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AcacaQ5SWU9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AcacaQ5SWU9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AcacaQ5SWU9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AcacaQ5SWU9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AcacaQ5SWU9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AcacaQ5SWU9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AcacaQ5SWU9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AcacaQ5SWU9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AcacaQ5SWU9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AcacaQ5SWU9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AcacaQ5SWU9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AcacaQ5SWU9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AcacaQ5SWU9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AcacaQ5SWU9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AcacaQ5SWU9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AcacaQ5SWU9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AcacaQ5SWU9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AcacaQ5SWU9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AcacaQ5SWU9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AcacaQ5SWU9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AcacaQ5SWU9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AcacaQ5SWU9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AcacaQ5SWU9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AcacaQ5SWU9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AcacaQ5SWU9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AcacaQ5SWU9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AcacaQ5SWU9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AcacaQ5SWU9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AcacaQ5SWU9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AcacaQ5SWU9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AcacaQ5SWU9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AcacaQ5SWU9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AcacaQ5SWU9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AcacaQ5SWU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AcacaQ5SWU9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AcacaQ5SWU9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AcacaQ5SWU9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AcacaQ5SWU9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AcacaQ5SWU9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AcacaQ5SWU9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AcacaQ5SWU9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AcacaQ5SWU9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AcacaQ5SWU9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AcacaQ5SWU9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AcacaQ5SWU9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AcacaQ5SWU9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AcacaQ5SWU9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms