Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AbrQ5SSL4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AbrQ5SSL4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AbrQ5SSL4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AbrQ5SSL4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AbrQ5SSL4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AbrQ5SSL4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AbrQ5SSL4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AbrQ5SSL4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AbrQ5SSL4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AbrQ5SSL4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AbrQ5SSL4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AbrQ5SSL4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AbrQ5SSL4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AbrQ5SSL4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AbrQ5SSL4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AbrQ5SSL4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AbrQ5SSL4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AbrQ5SSL4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AbrQ5SSL4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AbrQ5SSL4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AbrQ5SSL4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AbrQ5SSL4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AbrQ5SSL4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AbrQ5SSL4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AbrQ5SSL4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AbrQ5SSL4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AbrQ5SSL4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AbrQ5SSL4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AbrQ5SSL4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AbrQ5SSL4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AbrQ5SSL4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AbrQ5SSL4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
AbrQ5SSL4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AbrQ5SSL4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AbrQ5SSL4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AbrQ5SSL4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AbrQ5SSL4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AbrQ5SSL4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AbrQ5SSL4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AbrQ5SSL4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AbrQ5SSL4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AbrQ5SSL4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AbrQ5SSL4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AbrQ5SSL4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AbrQ5SSL4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AbrQ5SSL4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AbrQ5SSL4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AbrQ5SSL4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AbrQ5SSL4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AbrQ5SSL4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AbrQ5SSL4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AbrQ5SSL4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AbrQ5SSL4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AbrQ5SSL4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AbrQ5SSL4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AbrQ5SSL4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AbrQ5SSL4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AbrQ5SSL4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AbrQ5SSL4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AbrQ5SSL4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AbrQ5SSL4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AbrQ5SSL4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AbrQ5SSL4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AbrQ5SSL4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AbrQ5SSL4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AbrQ5SSL4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AbrQ5SSL4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AbrQ5SSL4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AbrQ5SSL4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AbrQ5SSL4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AbrQ5SSL4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AbrQ5SSL4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AbrQ5SSL4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AbrQ5SSL4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AbrQ5SSL4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AbrQ5SSL4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AbrQ5SSL4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AbrQ5SSL4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AbrQ5SSL4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AbrQ5SSL4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AbrQ5SSL4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AbrQ5SSL4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AbrQ5SSL4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AbrQ5SSL4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms