Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam20cQ5MJS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam20cQ5MJS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam20cQ5MJS3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam20cQ5MJS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam20cQ5MJS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam20cQ5MJS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam20cQ5MJS3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam20cQ5MJS3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam20cQ5MJS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam20cQ5MJS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam20cQ5MJS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam20cQ5MJS3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam20cQ5MJS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam20cQ5MJS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam20cQ5MJS3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam20cQ5MJS3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam20cQ5MJS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam20cQ5MJS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam20cQ5MJS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam20cQ5MJS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam20cQ5MJS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam20cQ5MJS3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam20cQ5MJS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20cQ5MJS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20cQ5MJS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam20cQ5MJS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam20cQ5MJS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam20cQ5MJS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam20cQ5MJS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20cQ5MJS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam20cQ5MJS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam20cQ5MJS3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam20cQ5MJS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam20cQ5MJS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam20cQ5MJS3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam20cQ5MJS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam20cQ5MJS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam20cQ5MJS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam20cQ5MJS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam20cQ5MJS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam20cQ5MJS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20cQ5MJS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20cQ5MJS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam20cQ5MJS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam20cQ5MJS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam20cQ5MJS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam20cQ5MJS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam20cQ5MJS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam20cQ5MJS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam20cQ5MJS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam20cQ5MJS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20cQ5MJS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam20cQ5MJS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20cQ5MJS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20cQ5MJS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam20cQ5MJS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam20cQ5MJS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam20cQ5MJS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam20cQ5MJS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam20cQ5MJS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms