Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3558Q5FWC9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3558Q5FWC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3558Q5FWC9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3558Q5FWC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3558Q5FWC9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3558Q5FWC9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3558Q5FWC9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3558Q5FWC9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3558Q5FWC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3558Q5FWC9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3558Q5FWC9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3558Q5FWC9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3558Q5FWC9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3558Q5FWC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3558Q5FWC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3558Q5FWC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3558Q5FWC9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3558Q5FWC9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3558Q5FWC9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3558Q5FWC9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3558Q5FWC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3558Q5FWC9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3558Q5FWC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3558Q5FWC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3558Q5FWC9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms