Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb1Q571H0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb1Q571H0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb1Q571H0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Urb1Q571H0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Urb1Q571H0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Urb1Q571H0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Urb1Q571H0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Urb1Q571H0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Urb1Q571H0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Urb1Q571H0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Urb1Q571H0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb1Q571H0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Urb1Q571H0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Urb1Q571H0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Urb1Q571H0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Urb1Q571H0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb1Q571H0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Urb1Q571H0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb1Q571H0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb1Q571H0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb1Q571H0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb1Q571H0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb1Q571H0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb1Q571H0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb1Q571H0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb1Q571H0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb1Q571H0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb1Q571H0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb1Q571H0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb1Q571H0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb1Q571H0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb1Q571H0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb1Q571H0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Urb1Q571H0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb1Q571H0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb1Q571H0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb1Q571H0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb1Q571H0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb1Q571H0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb1Q571H0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb1Q571H0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb1Q571H0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Urb1Q571H0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Urb1Q571H0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Urb1Q571H0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Urb1Q571H0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Urb1Q571H0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Urb1Q571H0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Urb1Q571H0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb1Q571H0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb1Q571H0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb1Q571H0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Urb1Q571H0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb1Q571H0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Urb1Q571H0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb1Q571H0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb1Q571H0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Urb1Q571H0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Urb1Q571H0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Urb1Q571H0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Urb1Q571H0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Urb1Q571H0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb1Q571H0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb1Q571H0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb1Q571H0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Urb1Q571H0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Urb1Q571H0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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