Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Opa3Q505D7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Opa3Q505D7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Opa3Q505D7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Opa3Q505D7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Opa3Q505D7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Opa3Q505D7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Opa3Q505D7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Opa3Q505D7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Opa3Q505D7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Opa3Q505D7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Opa3Q505D7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Opa3Q505D7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Opa3Q505D7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Opa3Q505D7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Opa3Q505D7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Opa3Q505D7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Opa3Q505D7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Opa3Q505D7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Opa3Q505D7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Opa3Q505D7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Opa3Q505D7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Opa3Q505D7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Opa3Q505D7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Opa3Q505D7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Opa3Q505D7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Opa3Q505D7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Opa3Q505D7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Opa3Q505D7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Opa3Q505D7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Opa3Q505D7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Opa3Q505D7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Opa3Q505D7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Opa3Q505D7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,87■■□□□ 1,41
Opa3Q505D7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Opa3Q505D7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Opa3Q505D7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Opa3Q505D7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Opa3Q505D7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Opa3Q505D7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Opa3Q505D7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Opa3Q505D7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Opa3Q505D7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Opa3Q505D7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Opa3Q505D7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Opa3Q505D7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Opa3Q505D7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Opa3Q505D7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Opa3Q505D7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Opa3Q505D7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Opa3Q505D7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Opa3Q505D7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Opa3Q505D7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Opa3Q505D7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Opa3Q505D7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Opa3Q505D7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Opa3Q505D7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Opa3Q505D7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Opa3Q505D7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Opa3Q505D7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Opa3Q505D7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Opa3Q505D7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Opa3Q505D7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,6 ms