Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa20Q45VN2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa20Q45VN2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa20Q45VN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa20Q45VN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa20Q45VN2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa20Q45VN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa20Q45VN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa20Q45VN2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa20Q45VN2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa20Q45VN2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa20Q45VN2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa20Q45VN2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa20Q45VN2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa20Q45VN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa20Q45VN2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa20Q45VN2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa20Q45VN2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa20Q45VN2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa20Q45VN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa20Q45VN2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa20Q45VN2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa20Q45VN2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa20Q45VN2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa20Q45VN2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa20Q45VN2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa20Q45VN2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa20Q45VN2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa20Q45VN2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa20Q45VN2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa20Q45VN2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms