Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Snx25Q3ZT31 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Snx25Q3ZT31 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snx25Q3ZT31 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Snx25Q3ZT31 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snx25Q3ZT31 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx25Q3ZT31 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx25Q3ZT31 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snx25Q3ZT31 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Snx25Q3ZT31 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Snx25Q3ZT31 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Snx25Q3ZT31 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx25Q3ZT31 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx25Q3ZT31 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Snx25Q3ZT31 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snx25Q3ZT31 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snx25Q3ZT31 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snx25Q3ZT31 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snx25Q3ZT31 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snx25Q3ZT31 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx25Q3ZT31 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snx25Q3ZT31 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snx25Q3ZT31 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snx25Q3ZT31 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snx25Q3ZT31 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snx25Q3ZT31 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snx25Q3ZT31 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx25Q3ZT31 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Snx25Q3ZT31 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snx25Q3ZT31 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx25Q3ZT31 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snx25Q3ZT31 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snx25Q3ZT31 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snx25Q3ZT31 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Snx25Q3ZT31 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snx25Q3ZT31 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snx25Q3ZT31 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snx25Q3ZT31 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Snx25Q3ZT31 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snx25Q3ZT31 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Snx25Q3ZT31 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Snx25Q3ZT31 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snx25Q3ZT31 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Snx25Q3ZT31 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snx25Q3ZT31 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snx25Q3ZT31 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snx25Q3ZT31 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snx25Q3ZT31 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx25Q3ZT31 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snx25Q3ZT31 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx25Q3ZT31 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx25Q3ZT31 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snx25Q3ZT31 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snx25Q3ZT31 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx25Q3ZT31 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snx25Q3ZT31 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snx25Q3ZT31 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx25Q3ZT31 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snx25Q3ZT31 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx25Q3ZT31 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx25Q3ZT31 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx25Q3ZT31 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx25Q3ZT31 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx25Q3ZT31 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx25Q3ZT31 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms