Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Carmil2Q3V3V9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Carmil2Q3V3V9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Carmil2Q3V3V9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Carmil2Q3V3V9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Carmil2Q3V3V9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Carmil2Q3V3V9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Carmil2Q3V3V9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil2Q3V3V9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Carmil2Q3V3V9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Carmil2Q3V3V9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Carmil2Q3V3V9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Carmil2Q3V3V9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Carmil2Q3V3V9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Carmil2Q3V3V9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Carmil2Q3V3V9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Carmil2Q3V3V9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Carmil2Q3V3V9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil2Q3V3V9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Carmil2Q3V3V9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Carmil2Q3V3V9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Carmil2Q3V3V9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Carmil2Q3V3V9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil2Q3V3V9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Carmil2Q3V3V9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Carmil2Q3V3V9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Carmil2Q3V3V9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Carmil2Q3V3V9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Carmil2Q3V3V9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Carmil2Q3V3V9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Carmil2Q3V3V9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Carmil2Q3V3V9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Carmil2Q3V3V9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Carmil2Q3V3V9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Carmil2Q3V3V9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Carmil2Q3V3V9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Carmil2Q3V3V9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Carmil2Q3V3V9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Carmil2Q3V3V9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Carmil2Q3V3V9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Carmil2Q3V3V9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Carmil2Q3V3V9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Carmil2Q3V3V9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Carmil2Q3V3V9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Carmil2Q3V3V9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Carmil2Q3V3V9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Carmil2Q3V3V9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Carmil2Q3V3V9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Carmil2Q3V3V9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Carmil2Q3V3V9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Carmil2Q3V3V9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Carmil2Q3V3V9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Carmil2Q3V3V9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Carmil2Q3V3V9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Carmil2Q3V3V9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Carmil2Q3V3V9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Carmil2Q3V3V9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil2Q3V3V9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Carmil2Q3V3V9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil2Q3V3V9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Carmil2Q3V3V9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Carmil2Q3V3V9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil2Q3V3V9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Carmil2Q3V3V9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Carmil2Q3V3V9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Carmil2Q3V3V9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil2Q3V3V9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Carmil2Q3V3V9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Carmil2Q3V3V9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Carmil2Q3V3V9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Carmil2Q3V3V9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Carmil2Q3V3V9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Carmil2Q3V3V9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Carmil2Q3V3V9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Carmil2Q3V3V9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Carmil2Q3V3V9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Carmil2Q3V3V9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Carmil2Q3V3V9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Carmil2Q3V3V9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms