Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itga1Q3V3R4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itga1Q3V3R4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Itga1Q3V3R4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itga1Q3V3R4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Itga1Q3V3R4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itga1Q3V3R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga1Q3V3R4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itga1Q3V3R4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga1Q3V3R4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga1Q3V3R4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itga1Q3V3R4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itga1Q3V3R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Itga1Q3V3R4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itga1Q3V3R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itga1Q3V3R4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itga1Q3V3R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itga1Q3V3R4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itga1Q3V3R4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga1Q3V3R4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga1Q3V3R4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga1Q3V3R4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga1Q3V3R4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itga1Q3V3R4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Itga1Q3V3R4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Itga1Q3V3R4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itga1Q3V3R4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itga1Q3V3R4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itga1Q3V3R4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itga1Q3V3R4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itga1Q3V3R4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itga1Q3V3R4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itga1Q3V3R4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itga1Q3V3R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itga1Q3V3R4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itga1Q3V3R4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itga1Q3V3R4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Itga1Q3V3R4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Itga1Q3V3R4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itga1Q3V3R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itga1Q3V3R4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itga1Q3V3R4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itga1Q3V3R4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Itga1Q3V3R4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Itga1Q3V3R4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Itga1Q3V3R4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Itga1Q3V3R4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga1Q3V3R4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Itga1Q3V3R4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itga1Q3V3R4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Itga1Q3V3R4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Itga1Q3V3R4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Itga1Q3V3R4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Itga1Q3V3R4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itga1Q3V3R4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga1Q3V3R4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Itga1Q3V3R4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga1Q3V3R4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga1Q3V3R4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga1Q3V3R4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Itga1Q3V3R4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga1Q3V3R4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Itga1Q3V3R4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga1Q3V3R4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Itga1Q3V3R4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Itga1Q3V3R4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga1Q3V3R4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga1Q3V3R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga1Q3V3R4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Itga1Q3V3R4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga1Q3V3R4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga1Q3V3R4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Itga1Q3V3R4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga1Q3V3R4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itga1Q3V3R4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga1Q3V3R4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Itga1Q3V3R4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itga1Q3V3R4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga1Q3V3R4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itga1Q3V3R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itga1Q3V3R4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Itga1Q3V3R4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itga1Q3V3R4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga1Q3V3R4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga1Q3V3R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms