Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd5Q3V1H9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd5Q3V1H9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd5Q3V1H9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd5Q3V1H9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd5Q3V1H9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd5Q3V1H9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd5Q3V1H9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd5Q3V1H9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd5Q3V1H9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd5Q3V1H9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd5Q3V1H9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd5Q3V1H9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd5Q3V1H9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd5Q3V1H9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd5Q3V1H9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samd5Q3V1H9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd5Q3V1H9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd5Q3V1H9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd5Q3V1H9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd5Q3V1H9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd5Q3V1H9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd5Q3V1H9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd5Q3V1H9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd5Q3V1H9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd5Q3V1H9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd5Q3V1H9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd5Q3V1H9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd5Q3V1H9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd5Q3V1H9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samd5Q3V1H9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd5Q3V1H9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samd5Q3V1H9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd5Q3V1H9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd5Q3V1H9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd5Q3V1H9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd5Q3V1H9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd5Q3V1H9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd5Q3V1H9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd5Q3V1H9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd5Q3V1H9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd5Q3V1H9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd5Q3V1H9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd5Q3V1H9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd5Q3V1H9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd5Q3V1H9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd5Q3V1H9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd5Q3V1H9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd5Q3V1H9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd5Q3V1H9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Samd5Q3V1H9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Samd5Q3V1H9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd5Q3V1H9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samd5Q3V1H9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samd5Q3V1H9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samd5Q3V1H9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd5Q3V1H9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd5Q3V1H9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd5Q3V1H9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd5Q3V1H9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd5Q3V1H9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd5Q3V1H9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms