Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Clca4bQ3UW98 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Clca4bQ3UW98 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Clca4bQ3UW98 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Clca4bQ3UW98 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Clca4bQ3UW98 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Clca4bQ3UW98 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Clca4bQ3UW98 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Clca4bQ3UW98 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Clca4bQ3UW98 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Clca4bQ3UW98 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Clca4bQ3UW98 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Clca4bQ3UW98 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Clca4bQ3UW98 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Clca4bQ3UW98 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Clca4bQ3UW98 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Clca4bQ3UW98 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Clca4bQ3UW98 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Clca4bQ3UW98 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Clca4bQ3UW98 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Clca4bQ3UW98 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Clca4bQ3UW98 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Clca4bQ3UW98 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Clca4bQ3UW98 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Clca4bQ3UW98 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Clca4bQ3UW98 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Clca4bQ3UW98 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Clca4bQ3UW98 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Clca4bQ3UW98 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Clca4bQ3UW98 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Clca4bQ3UW98 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Clca4bQ3UW98 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Clca4bQ3UW98 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Clca4bQ3UW98 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Clca4bQ3UW98 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Clca4bQ3UW98 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Clca4bQ3UW98 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Clca4bQ3UW98 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Clca4bQ3UW98 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Clca4bQ3UW98 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Clca4bQ3UW98 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Clca4bQ3UW98 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Clca4bQ3UW98 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Clca4bQ3UW98 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Clca4bQ3UW98 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Clca4bQ3UW98 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Clca4bQ3UW98 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Clca4bQ3UW98 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Clca4bQ3UW98 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Clca4bQ3UW98 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Clca4bQ3UW98 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Clca4bQ3UW98 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Clca4bQ3UW98 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Clca4bQ3UW98 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Clca4bQ3UW98 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Clca4bQ3UW98 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Clca4bQ3UW98 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Clca4bQ3UW98 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Clca4bQ3UW98 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Clca4bQ3UW98 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Clca4bQ3UW98 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Clca4bQ3UW98 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Clca4bQ3UW98 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms