Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Prom2Q3UUY6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Prom2Q3UUY6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Prom2Q3UUY6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Prom2Q3UUY6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Prom2Q3UUY6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Prom2Q3UUY6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Prom2Q3UUY6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Prom2Q3UUY6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Prom2Q3UUY6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Prom2Q3UUY6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Prom2Q3UUY6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Prom2Q3UUY6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Prom2Q3UUY6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Prom2Q3UUY6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Prom2Q3UUY6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Prom2Q3UUY6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Prom2Q3UUY6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Prom2Q3UUY6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Prom2Q3UUY6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Prom2Q3UUY6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Prom2Q3UUY6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Prom2Q3UUY6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Prom2Q3UUY6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Prom2Q3UUY6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Prom2Q3UUY6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Prom2Q3UUY6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Prom2Q3UUY6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
Prom2Q3UUY6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Prom2Q3UUY6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Prom2Q3UUY6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Prom2Q3UUY6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Prom2Q3UUY6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Prom2Q3UUY6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Prom2Q3UUY6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Prom2Q3UUY6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Prom2Q3UUY6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Prom2Q3UUY6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Prom2Q3UUY6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Prom2Q3UUY6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Prom2Q3UUY6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Prom2Q3UUY6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Prom2Q3UUY6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Prom2Q3UUY6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Prom2Q3UUY6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Prom2Q3UUY6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Prom2Q3UUY6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Prom2Q3UUY6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Prom2Q3UUY6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Prom2Q3UUY6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Prom2Q3UUY6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Prom2Q3UUY6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Prom2Q3UUY6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Prom2Q3UUY6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Prom2Q3UUY6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Prom2Q3UUY6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Prom2Q3UUY6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Prom2Q3UUY6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Prom2Q3UUY6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Prom2Q3UUY6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Prom2Q3UUY6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Prom2Q3UUY6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Prom2Q3UUY6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Prom2Q3UUY6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Prom2Q3UUY6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Prom2Q3UUY6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Prom2Q3UUY6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Prom2Q3UUY6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Prom2Q3UUY6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Prom2Q3UUY6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Prom2Q3UUY6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Prom2Q3UUY6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Prom2Q3UUY6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Prom2Q3UUY6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Prom2Q3UUY6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Prom2Q3UUY6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Prom2Q3UUY6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Prom2Q3UUY6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Prom2Q3UUY6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Prom2Q3UUY6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Prom2Q3UUY6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Prom2Q3UUY6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Prom2Q3UUY6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Prom2Q3UUY6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Prom2Q3UUY6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Prom2Q3UUY6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Prom2Q3UUY6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Prom2Q3UUY6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Prom2Q3UUY6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Prom2Q3UUY6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Prom2Q3UUY6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Prom2Q3UUY6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Prom2Q3UUY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Prom2Q3UUY6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms