Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc61Q3UJV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc61Q3UJV1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Ccdc61Q3UJV1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ccdc61Q3UJV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ccdc61Q3UJV1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ccdc61Q3UJV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ccdc61Q3UJV1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Ccdc61Q3UJV1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ccdc61Q3UJV1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ccdc61Q3UJV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ccdc61Q3UJV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Ccdc61Q3UJV1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ccdc61Q3UJV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ccdc61Q3UJV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc61Q3UJV1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc61Q3UJV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ccdc61Q3UJV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ccdc61Q3UJV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ccdc61Q3UJV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Ccdc61Q3UJV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Ccdc61Q3UJV1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ccdc61Q3UJV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ccdc61Q3UJV1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ccdc61Q3UJV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc61Q3UJV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ccdc61Q3UJV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc61Q3UJV1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ccdc61Q3UJV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ccdc61Q3UJV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc61Q3UJV1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ccdc61Q3UJV1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ccdc61Q3UJV1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ccdc61Q3UJV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ccdc61Q3UJV1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ccdc61Q3UJV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc61Q3UJV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc61Q3UJV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ccdc61Q3UJV1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc61Q3UJV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc61Q3UJV1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc61Q3UJV1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc61Q3UJV1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc61Q3UJV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc61Q3UJV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ccdc61Q3UJV1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ccdc61Q3UJV1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Ccdc61Q3UJV1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ccdc61Q3UJV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ccdc61Q3UJV1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ccdc61Q3UJV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ccdc61Q3UJV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ccdc61Q3UJV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ccdc61Q3UJV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ccdc61Q3UJV1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ccdc61Q3UJV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ccdc61Q3UJV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc61Q3UJV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ccdc61Q3UJV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ccdc61Q3UJV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccdc61Q3UJV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ccdc61Q3UJV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc61Q3UJV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc61Q3UJV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ccdc61Q3UJV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccdc61Q3UJV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc61Q3UJV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc61Q3UJV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccdc61Q3UJV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccdc61Q3UJV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccdc61Q3UJV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccdc61Q3UJV1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms