Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcrip1Q3UGS4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcrip1Q3UGS4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcrip1Q3UGS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcrip1Q3UGS4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcrip1Q3UGS4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcrip1Q3UGS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcrip1Q3UGS4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcrip1Q3UGS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcrip1Q3UGS4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcrip1Q3UGS4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcrip1Q3UGS4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mcrip1Q3UGS4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mcrip1Q3UGS4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mcrip1Q3UGS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcrip1Q3UGS4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mcrip1Q3UGS4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mcrip1Q3UGS4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mcrip1Q3UGS4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mcrip1Q3UGS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mcrip1Q3UGS4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mcrip1Q3UGS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mcrip1Q3UGS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mcrip1Q3UGS4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mcrip1Q3UGS4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mcrip1Q3UGS4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mcrip1Q3UGS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mcrip1Q3UGS4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mcrip1Q3UGS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mcrip1Q3UGS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mcrip1Q3UGS4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mcrip1Q3UGS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mcrip1Q3UGS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mcrip1Q3UGS4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mcrip1Q3UGS4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mcrip1Q3UGS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcrip1Q3UGS4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mcrip1Q3UGS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mcrip1Q3UGS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcrip1Q3UGS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcrip1Q3UGS4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcrip1Q3UGS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrip1Q3UGS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrip1Q3UGS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrip1Q3UGS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcrip1Q3UGS4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mcrip1Q3UGS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mcrip1Q3UGS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcrip1Q3UGS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcrip1Q3UGS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mcrip1Q3UGS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms