Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VwceQ3U515 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VwceQ3U515 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VwceQ3U515 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VwceQ3U515 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VwceQ3U515 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VwceQ3U515 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VwceQ3U515 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VwceQ3U515 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VwceQ3U515 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VwceQ3U515 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VwceQ3U515 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VwceQ3U515 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VwceQ3U515 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VwceQ3U515 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VwceQ3U515 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VwceQ3U515 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VwceQ3U515 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VwceQ3U515 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VwceQ3U515 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VwceQ3U515 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VwceQ3U515 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VwceQ3U515 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VwceQ3U515 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VwceQ3U515 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VwceQ3U515 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VwceQ3U515 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VwceQ3U515 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VwceQ3U515 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VwceQ3U515 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VwceQ3U515 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VwceQ3U515 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VwceQ3U515 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VwceQ3U515 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VwceQ3U515 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VwceQ3U515 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VwceQ3U515 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VwceQ3U515 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VwceQ3U515 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VwceQ3U515 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VwceQ3U515 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VwceQ3U515 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VwceQ3U515 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VwceQ3U515 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VwceQ3U515 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VwceQ3U515 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VwceQ3U515 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VwceQ3U515 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VwceQ3U515 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VwceQ3U515 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VwceQ3U515 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VwceQ3U515 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VwceQ3U515 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VwceQ3U515 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VwceQ3U515 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VwceQ3U515 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VwceQ3U515 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VwceQ3U515 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VwceQ3U515 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VwceQ3U515 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VwceQ3U515 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VwceQ3U515 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms