Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,82■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
VwceQ3U515 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
VwceQ3U515 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
VwceQ3U515 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,71■■□□□ 1,87
VwceQ3U515 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
VwceQ3U515 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
VwceQ3U515 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
VwceQ3U515 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
VwceQ3U515 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
VwceQ3U515 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
VwceQ3U515 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
VwceQ3U515 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
VwceQ3U515 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
VwceQ3U515 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
VwceQ3U515 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
VwceQ3U515 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
VwceQ3U515 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
VwceQ3U515 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
VwceQ3U515 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
VwceQ3U515 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
VwceQ3U515 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
VwceQ3U515 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
VwceQ3U515 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
VwceQ3U515 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
VwceQ3U515 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
VwceQ3U515 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
VwceQ3U515 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
VwceQ3U515 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
VwceQ3U515 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
VwceQ3U515 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
VwceQ3U515 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
VwceQ3U515 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
VwceQ3U515 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
VwceQ3U515 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
VwceQ3U515 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
VwceQ3U515 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
VwceQ3U515 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
VwceQ3U515 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
VwceQ3U515 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
VwceQ3U515 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
VwceQ3U515 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
VwceQ3U515 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
VwceQ3U515 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
VwceQ3U515 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
VwceQ3U515 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
VwceQ3U515 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
VwceQ3U515 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
VwceQ3U515 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
VwceQ3U515 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
VwceQ3U515 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
VwceQ3U515 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
VwceQ3U515 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
VwceQ3U515 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
VwceQ3U515 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
VwceQ3U515 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
VwceQ3U515 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
VwceQ3U515 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
VwceQ3U515 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
VwceQ3U515 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
VwceQ3U515 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
VwceQ3U515 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
VwceQ3U515 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms