Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gse1Q3U3C9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gse1Q3U3C9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Gse1Q3U3C9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Gse1Q3U3C9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gse1Q3U3C9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gse1Q3U3C9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gse1Q3U3C9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gse1Q3U3C9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gse1Q3U3C9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gse1Q3U3C9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gse1Q3U3C9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gse1Q3U3C9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gse1Q3U3C9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gse1Q3U3C9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gse1Q3U3C9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gse1Q3U3C9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gse1Q3U3C9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gse1Q3U3C9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gse1Q3U3C9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gse1Q3U3C9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gse1Q3U3C9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gse1Q3U3C9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gse1Q3U3C9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gse1Q3U3C9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gse1Q3U3C9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gse1Q3U3C9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gse1Q3U3C9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gse1Q3U3C9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gse1Q3U3C9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gse1Q3U3C9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gse1Q3U3C9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gse1Q3U3C9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Gse1Q3U3C9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gse1Q3U3C9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gse1Q3U3C9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Gse1Q3U3C9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gse1Q3U3C9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gse1Q3U3C9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Gse1Q3U3C9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gse1Q3U3C9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gse1Q3U3C9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gse1Q3U3C9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gse1Q3U3C9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gse1Q3U3C9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gse1Q3U3C9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gse1Q3U3C9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gse1Q3U3C9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gse1Q3U3C9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gse1Q3U3C9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gse1Q3U3C9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gse1Q3U3C9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gse1Q3U3C9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gse1Q3U3C9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gse1Q3U3C9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gse1Q3U3C9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gse1Q3U3C9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gse1Q3U3C9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gse1Q3U3C9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gse1Q3U3C9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Gse1Q3U3C9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gse1Q3U3C9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gse1Q3U3C9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gse1Q3U3C9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gse1Q3U3C9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gse1Q3U3C9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gse1Q3U3C9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gse1Q3U3C9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Gse1Q3U3C9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gse1Q3U3C9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gse1Q3U3C9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gse1Q3U3C9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gse1Q3U3C9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gse1Q3U3C9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gse1Q3U3C9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gse1Q3U3C9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gse1Q3U3C9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gse1Q3U3C9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gse1Q3U3C9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gse1Q3U3C9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gse1Q3U3C9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gse1Q3U3C9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gse1Q3U3C9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gse1Q3U3C9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gse1Q3U3C9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gse1Q3U3C9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gse1Q3U3C9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms