Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde12Q3TIU4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde12Q3TIU4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde12Q3TIU4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde12Q3TIU4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde12Q3TIU4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde12Q3TIU4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde12Q3TIU4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde12Q3TIU4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde12Q3TIU4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde12Q3TIU4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde12Q3TIU4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde12Q3TIU4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde12Q3TIU4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde12Q3TIU4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde12Q3TIU4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde12Q3TIU4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde12Q3TIU4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde12Q3TIU4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde12Q3TIU4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde12Q3TIU4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde12Q3TIU4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde12Q3TIU4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde12Q3TIU4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde12Q3TIU4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde12Q3TIU4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde12Q3TIU4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde12Q3TIU4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde12Q3TIU4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde12Q3TIU4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde12Q3TIU4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde12Q3TIU4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde12Q3TIU4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde12Q3TIU4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde12Q3TIU4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde12Q3TIU4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde12Q3TIU4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde12Q3TIU4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde12Q3TIU4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde12Q3TIU4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde12Q3TIU4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde12Q3TIU4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde12Q3TIU4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde12Q3TIU4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde12Q3TIU4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde12Q3TIU4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde12Q3TIU4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde12Q3TIU4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde12Q3TIU4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde12Q3TIU4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde12Q3TIU4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pde12Q3TIU4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde12Q3TIU4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde12Q3TIU4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde12Q3TIU4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde12Q3TIU4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde12Q3TIU4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pde12Q3TIU4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde12Q3TIU4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde12Q3TIU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pde12Q3TIU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pde12Q3TIU4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde12Q3TIU4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pde12Q3TIU4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pde12Q3TIU4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pde12Q3TIU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pde12Q3TIU4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pde12Q3TIU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde12Q3TIU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde12Q3TIU4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde12Q3TIU4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms