Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb8Q0VBD0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb8Q0VBD0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb8Q0VBD0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itgb8Q0VBD0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itgb8Q0VBD0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itgb8Q0VBD0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb8Q0VBD0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb8Q0VBD0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itgb8Q0VBD0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb8Q0VBD0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb8Q0VBD0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb8Q0VBD0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb8Q0VBD0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb8Q0VBD0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb8Q0VBD0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb8Q0VBD0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb8Q0VBD0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb8Q0VBD0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb8Q0VBD0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb8Q0VBD0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb8Q0VBD0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb8Q0VBD0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb8Q0VBD0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb8Q0VBD0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb8Q0VBD0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb8Q0VBD0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb8Q0VBD0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb8Q0VBD0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb8Q0VBD0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itgb8Q0VBD0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb8Q0VBD0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb8Q0VBD0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb8Q0VBD0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb8Q0VBD0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb8Q0VBD0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb8Q0VBD0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb8Q0VBD0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Itgb8Q0VBD0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb8Q0VBD0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb8Q0VBD0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb8Q0VBD0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb8Q0VBD0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb8Q0VBD0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb8Q0VBD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb8Q0VBD0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb8Q0VBD0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb8Q0VBD0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb8Q0VBD0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb8Q0VBD0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb8Q0VBD0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb8Q0VBD0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb8Q0VBD0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb8Q0VBD0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms