Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Col9a2Q07643 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Col9a2Q07643 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Col9a2Q07643 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Col9a2Q07643 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Col9a2Q07643 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Col9a2Q07643 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Col9a2Q07643 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Col9a2Q07643 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Col9a2Q07643 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Col9a2Q07643 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Col9a2Q07643 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Col9a2Q07643 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Col9a2Q07643 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Col9a2Q07643 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Col9a2Q07643 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Col9a2Q07643 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Col9a2Q07643 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Col9a2Q07643 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Col9a2Q07643 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Col9a2Q07643 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Col9a2Q07643 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Col9a2Q07643 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Col9a2Q07643 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Col9a2Q07643 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Col9a2Q07643 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Col9a2Q07643 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Col9a2Q07643 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Col9a2Q07643 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Col9a2Q07643 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Col9a2Q07643 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Col9a2Q07643 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Col9a2Q07643 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Col9a2Q07643 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Col9a2Q07643 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Col9a2Q07643 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Col9a2Q07643 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Col9a2Q07643 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Col9a2Q07643 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Col9a2Q07643 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Col9a2Q07643 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Col9a2Q07643 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Col9a2Q07643 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Col9a2Q07643 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
Col9a2Q07643 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Col9a2Q07643 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Col9a2Q07643 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Col9a2Q07643 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Col9a2Q07643 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Col9a2Q07643 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Col9a2Q07643 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Col9a2Q07643 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Col9a2Q07643 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Col9a2Q07643 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Col9a2Q07643 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Col9a2Q07643 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Col9a2Q07643 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Col9a2Q07643 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Col9a2Q07643 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Col9a2Q07643 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Col9a2Q07643 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Col9a2Q07643 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Col9a2Q07643 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Col9a2Q07643 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Col9a2Q07643 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Col9a2Q07643 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Col9a2Q07643 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Col9a2Q07643 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Col9a2Q07643 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Col9a2Q07643 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Col9a2Q07643 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Col9a2Q07643 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Col9a2Q07643 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Col9a2Q07643 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Col9a2Q07643 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Col9a2Q07643 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Col9a2Q07643 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Col9a2Q07643 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col9a2Q07643 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Col9a2Q07643 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Col9a2Q07643 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Col9a2Q07643 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Col9a2Q07643 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Col9a2Q07643 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col9a2Q07643 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col9a2Q07643 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col9a2Q07643 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Col9a2Q07643 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Col9a2Q07643 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Col9a2Q07643 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Col9a2Q07643 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Col9a2Q07643 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Col9a2Q07643 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,1 ms