Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CluQ06890 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CluQ06890 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CluQ06890 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CluQ06890 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CluQ06890 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluQ06890 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluQ06890 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluQ06890 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CluQ06890 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CluQ06890 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluQ06890 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CluQ06890 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CluQ06890 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluQ06890 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluQ06890 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluQ06890 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluQ06890 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluQ06890 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluQ06890 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluQ06890 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluQ06890 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluQ06890 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluQ06890 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CluQ06890 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CluQ06890 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CluQ06890 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluQ06890 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CluQ06890 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CluQ06890 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CluQ06890 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluQ06890 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluQ06890 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CluQ06890 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CluQ06890 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluQ06890 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CluQ06890 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CluQ06890 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CluQ06890 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CluQ06890 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CluQ06890 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CluQ06890 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CluQ06890 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CluQ06890 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CluQ06890 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CluQ06890 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CluQ06890 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CluQ06890 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CluQ06890 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluQ06890 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CluQ06890 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluQ06890 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluQ06890 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluQ06890 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluQ06890 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluQ06890 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CluQ06890 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluQ06890 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluQ06890 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluQ06890 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CluQ06890 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluQ06890 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluQ06890 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluQ06890 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CluQ06890 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluQ06890 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CluQ06890 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CluQ06890 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CluQ06890 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CluQ06890 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CluQ06890 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CluQ06890 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CluQ06890 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CluQ06890 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CluQ06890 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CluQ06890 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CluQ06890 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CluQ06890 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CluQ06890 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CluQ06890 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CluQ06890 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluQ06890 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluQ06890 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CluQ06890 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluQ06890 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluQ06890 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluQ06890 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluQ06890 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluQ06890 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluQ06890 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluQ06890 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluQ06890 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluQ06890 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluQ06890 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluQ06890 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluQ06890 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CluQ06890 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CluQ06890 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluQ06890 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluQ06890 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms