Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Sox10Q04888 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sox10Q04888 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sox10Q04888 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sox10Q04888 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sox10Q04888 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sox10Q04888 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sox10Q04888 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Sox10Q04888 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sox10Q04888 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sox10Q04888 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox10Q04888 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox10Q04888 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Sox10Q04888 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sox10Q04888 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sox10Q04888 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox10Q04888 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox10Q04888 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox10Q04888 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sox10Q04888 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sox10Q04888 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sox10Q04888 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sox10Q04888 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sox10Q04888 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sox10Q04888 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sox10Q04888 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sox10Q04888 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Sox10Q04888 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Sox10Q04888 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sox10Q04888 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sox10Q04888 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sox10Q04888 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sox10Q04888 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sox10Q04888 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sox10Q04888 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sox10Q04888 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sox10Q04888 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sox10Q04888 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sox10Q04888 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sox10Q04888 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sox10Q04888 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sox10Q04888 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sox10Q04888 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sox10Q04888 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sox10Q04888 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sox10Q04888 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sox10Q04888 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Sox10Q04888 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sox10Q04888 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox10Q04888 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox10Q04888 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sox10Q04888 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sox10Q04888 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sox10Q04888 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sox10Q04888 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sox10Q04888 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sox10Q04888 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sox10Q04888 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sox10Q04888 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sox10Q04888 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sox10Q04888 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sox10Q04888 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sox10Q04888 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sox10Q04888 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sox10Q04888 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Sox10Q04888 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sox10Q04888 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sox10Q04888 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sox10Q04888 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Sox10Q04888 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox10Q04888 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox10Q04888 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Sox10Q04888 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sox10Q04888 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox10Q04888 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sox10Q04888 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sox10Q04888 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Sox10Q04888 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Sox10Q04888 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox10Q04888 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox10Q04888 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sox10Q04888 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sox10Q04888 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sox10Q04888 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox10Q04888 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sox10Q04888 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms