Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
Cacna1sQ02789 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cacna1sQ02789 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Cacna1sQ02789 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Cacna1sQ02789 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,58
Cacna1sQ02789 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37,29■■■■□ 3,56
Cacna1sQ02789 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Cacna1sQ02789 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Cacna1sQ02789 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Cacna1sQ02789 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Cacna1sQ02789 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Cacna1sQ02789 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Cacna1sQ02789 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Cacna1sQ02789 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Cacna1sQ02789 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Cacna1sQ02789 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,53
Cacna1sQ02789 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Cacna1sQ02789 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Cacna1sQ02789 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Cacna1sQ02789 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Cacna1sQ02789 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cacna1sQ02789 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Cacna1sQ02789 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cacna1sQ02789 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Cacna1sQ02789 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Cacna1sQ02789 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Cacna1sQ02789 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Cacna1sQ02789 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Cacna1sQ02789 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Cacna1sQ02789 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Cacna1sQ02789 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
Cacna1sQ02789 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cacna1sQ02789 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36,74■■■■□ 3,47
Cacna1sQ02789 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Cacna1sQ02789 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Cacna1sQ02789 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Cacna1sQ02789 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,64■■■■□ 3,46
Cacna1sQ02789 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36,63■■■■□ 3,45
Cacna1sQ02789 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Cacna1sQ02789 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,48■■■■□ 3,43
Cacna1sQ02789 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cacna1sQ02789 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cacna1sQ02789 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Cacna1sQ02789 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Cacna1sQ02789 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Cacna1sQ02789 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cacna1sQ02789 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Cacna1sQ02789 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cacna1sQ02789 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cacna1sQ02789 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cacna1sQ02789 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Cacna1sQ02789 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,24■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Cacna1sQ02789 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Cacna1sQ02789 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cacna1sQ02789 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cacna1sQ02789 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Cacna1sQ02789 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Cacna1sQ02789 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Cacna1sQ02789 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Cacna1sQ02789 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Cacna1sQ02789 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Cacna1sQ02789 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cacna1sQ02789 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Cacna1sQ02789 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Cacna1sQ02789 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Cacna1sQ02789 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Cacna1sQ02789 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Cacna1sQ02789 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Cacna1sQ02789 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Cacna1sQ02789 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Cacna1sQ02789 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Cacna1sQ02789 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Cacna1sQ02789 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Cacna1sQ02789 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Cacna1sQ02789 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Cacna1sQ02789 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35,77■■■■□ 3,32
Cacna1sQ02789 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Cacna1sQ02789 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Cacna1sQ02789 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Cacna1sQ02789 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Cacna1sQ02789 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Cacna1sQ02789 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35,7■■■■□ 3,31
Cacna1sQ02789 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Cacna1sQ02789 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Cacna1sQ02789 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Cacna1sQ02789 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Cacna1sQ02789 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Cacna1sQ02789 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,8 ms