Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col6a2Q02788 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col6a2Q02788 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col6a2Q02788 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col6a2Q02788 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col6a2Q02788 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col6a2Q02788 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col6a2Q02788 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col6a2Q02788 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Col6a2Q02788 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col6a2Q02788 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col6a2Q02788 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col6a2Q02788 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col6a2Q02788 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col6a2Q02788 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col6a2Q02788 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col6a2Q02788 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col6a2Q02788 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col6a2Q02788 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col6a2Q02788 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col6a2Q02788 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col6a2Q02788 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Col6a2Q02788 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col6a2Q02788 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col6a2Q02788 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Col6a2Q02788 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col6a2Q02788 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col6a2Q02788 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col6a2Q02788 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col6a2Q02788 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Col6a2Q02788 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col6a2Q02788 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col6a2Q02788 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col6a2Q02788 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col6a2Q02788 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Col6a2Q02788 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col6a2Q02788 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col6a2Q02788 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col6a2Q02788 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col6a2Q02788 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col6a2Q02788 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col6a2Q02788 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Col6a2Q02788 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col6a2Q02788 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col6a2Q02788 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col6a2Q02788 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col6a2Q02788 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Col6a2Q02788 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col6a2Q02788 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col6a2Q02788 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col6a2Q02788 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col6a2Q02788 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Col6a2Q02788 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col6a2Q02788 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col6a2Q02788 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Col6a2Q02788 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col6a2Q02788 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col6a2Q02788 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col6a2Q02788 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col6a2Q02788 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col6a2Q02788 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col6a2Q02788 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col6a2Q02788 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col6a2Q02788 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col6a2Q02788 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col6a2Q02788 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col6a2Q02788 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col6a2Q02788 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col6a2Q02788 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col6a2Q02788 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col6a2Q02788 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col6a2Q02788 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col6a2Q02788 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col6a2Q02788 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col6a2Q02788 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col6a2Q02788 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col6a2Q02788 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col6a2Q02788 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col6a2Q02788 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col6a2Q02788 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col6a2Q02788 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col6a2Q02788 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col6a2Q02788 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col6a2Q02788 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms