Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp39Q02525 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp39Q02525 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp39Q02525 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp39Q02525 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp39Q02525 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp39Q02525 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp39Q02525 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp39Q02525 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp39Q02525 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp39Q02525 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp39Q02525 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp39Q02525 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp39Q02525 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp39Q02525 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp39Q02525 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zfp39Q02525 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp39Q02525 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp39Q02525 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp39Q02525 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfp39Q02525 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp39Q02525 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp39Q02525 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp39Q02525 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp39Q02525 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp39Q02525 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp39Q02525 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp39Q02525 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp39Q02525 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp39Q02525 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp39Q02525 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp39Q02525 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp39Q02525 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp39Q02525 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp39Q02525 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp39Q02525 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp39Q02525 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp39Q02525 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp39Q02525 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp39Q02525 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp39Q02525 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp39Q02525 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp39Q02525 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp39Q02525 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp39Q02525 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp39Q02525 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfp39Q02525 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp39Q02525 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp39Q02525 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp39Q02525 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp39Q02525 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp39Q02525 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp39Q02525 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp39Q02525 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp39Q02525 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp39Q02525 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp39Q02525 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp39Q02525 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp39Q02525 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp39Q02525 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp39Q02525 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp39Q02525 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp39Q02525 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms