Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VcpQ01853 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VcpQ01853 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VcpQ01853 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VcpQ01853 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VcpQ01853 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VcpQ01853 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VcpQ01853 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VcpQ01853 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VcpQ01853 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VcpQ01853 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VcpQ01853 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VcpQ01853 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VcpQ01853 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VcpQ01853 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VcpQ01853 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VcpQ01853 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VcpQ01853 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VcpQ01853 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VcpQ01853 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VcpQ01853 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VcpQ01853 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VcpQ01853 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VcpQ01853 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VcpQ01853 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VcpQ01853 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VcpQ01853 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VcpQ01853 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VcpQ01853 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VcpQ01853 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VcpQ01853 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VcpQ01853 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VcpQ01853 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VcpQ01853 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VcpQ01853 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VcpQ01853 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VcpQ01853 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VcpQ01853 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VcpQ01853 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VcpQ01853 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VcpQ01853 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VcpQ01853 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VcpQ01853 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VcpQ01853 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VcpQ01853 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VcpQ01853 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VcpQ01853 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VcpQ01853 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VcpQ01853 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VcpQ01853 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VcpQ01853 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VcpQ01853 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
VcpQ01853 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VcpQ01853 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VcpQ01853 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VcpQ01853 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VcpQ01853 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VcpQ01853 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VcpQ01853 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VcpQ01853 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VcpQ01853 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VcpQ01853 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VcpQ01853 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VcpQ01853 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VcpQ01853 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VcpQ01853 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VcpQ01853 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VcpQ01853 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VcpQ01853 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VcpQ01853 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VcpQ01853 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VcpQ01853 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VcpQ01853 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VcpQ01853 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VcpQ01853 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VcpQ01853 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VcpQ01853 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VcpQ01853 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VcpQ01853 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VcpQ01853 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VcpQ01853 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VcpQ01853 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VcpQ01853 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms