Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HmgcrQ01237 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HmgcrQ01237 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HmgcrQ01237 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HmgcrQ01237 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HmgcrQ01237 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HmgcrQ01237 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HmgcrQ01237 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HmgcrQ01237 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
HmgcrQ01237 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HmgcrQ01237 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HmgcrQ01237 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HmgcrQ01237 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HmgcrQ01237 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HmgcrQ01237 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HmgcrQ01237 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HmgcrQ01237 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HmgcrQ01237 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HmgcrQ01237 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HmgcrQ01237 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HmgcrQ01237 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HmgcrQ01237 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HmgcrQ01237 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HmgcrQ01237 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HmgcrQ01237 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HmgcrQ01237 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HmgcrQ01237 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HmgcrQ01237 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
HmgcrQ01237 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HmgcrQ01237 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HmgcrQ01237 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HmgcrQ01237 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HmgcrQ01237 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
HmgcrQ01237 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
HmgcrQ01237 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HmgcrQ01237 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HmgcrQ01237 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
HmgcrQ01237 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HmgcrQ01237 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
HmgcrQ01237 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HmgcrQ01237 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HmgcrQ01237 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HmgcrQ01237 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HmgcrQ01237 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HmgcrQ01237 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HmgcrQ01237 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HmgcrQ01237 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HmgcrQ01237 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HmgcrQ01237 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HmgcrQ01237 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HmgcrQ01237 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HmgcrQ01237 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HmgcrQ01237 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
HmgcrQ01237 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HmgcrQ01237 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HmgcrQ01237 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HmgcrQ01237 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HmgcrQ01237 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HmgcrQ01237 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HmgcrQ01237 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HmgcrQ01237 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HmgcrQ01237 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HmgcrQ01237 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HmgcrQ01237 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HmgcrQ01237 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HmgcrQ01237 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HmgcrQ01237 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HmgcrQ01237 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HmgcrQ01237 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HmgcrQ01237 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HmgcrQ01237 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HmgcrQ01237 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HmgcrQ01237 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HmgcrQ01237 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms