Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Flt3Q00342 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Flt3Q00342 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Flt3Q00342 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Flt3Q00342 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Flt3Q00342 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Flt3Q00342 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Flt3Q00342 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Flt3Q00342 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Flt3Q00342 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Flt3Q00342 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Flt3Q00342 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Flt3Q00342 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Flt3Q00342 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Flt3Q00342 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Flt3Q00342 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Flt3Q00342 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Flt3Q00342 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Flt3Q00342 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Flt3Q00342 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Flt3Q00342 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Flt3Q00342 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Flt3Q00342 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Flt3Q00342 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Flt3Q00342 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Flt3Q00342 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Flt3Q00342 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Flt3Q00342 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Flt3Q00342 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Flt3Q00342 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Flt3Q00342 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Flt3Q00342 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Flt3Q00342 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Flt3Q00342 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Flt3Q00342 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Flt3Q00342 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Flt3Q00342 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Flt3Q00342 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Flt3Q00342 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Flt3Q00342 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Flt3Q00342 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Flt3Q00342 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Flt3Q00342 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Flt3Q00342 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Flt3Q00342 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Flt3Q00342 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Flt3Q00342 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Flt3Q00342 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Flt3Q00342 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Flt3Q00342 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Flt3Q00342 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Flt3Q00342 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Flt3Q00342 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Flt3Q00342 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Flt3Q00342 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Flt3Q00342 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Flt3Q00342 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Flt3Q00342 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Flt3Q00342 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Flt3Q00342 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Flt3Q00342 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Flt3Q00342 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Flt3Q00342 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Flt3Q00342 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Flt3Q00342 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Flt3Q00342 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Flt3Q00342 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Flt3Q00342 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Flt3Q00342 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Flt3Q00342 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flt3Q00342 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flt3Q00342 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt3Q00342 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt3Q00342 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt3Q00342 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt3Q00342 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Flt3Q00342 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt3Q00342 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt3Q00342 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt3Q00342 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt3Q00342 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt3Q00342 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms