Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
Brca2P97929 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Brca2P97929 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Brca2P97929 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Brca2P97929 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Brca2P97929 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Brca2P97929 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Brca2P97929 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Brca2P97929 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Brca2P97929 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Brca2P97929 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Brca2P97929 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Brca2P97929 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Brca2P97929 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Brca2P97929 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Brca2P97929 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Brca2P97929 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Brca2P97929 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Brca2P97929 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Brca2P97929 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Brca2P97929 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Brca2P97929 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Brca2P97929 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Brca2P97929 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Brca2P97929 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Brca2P97929 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Brca2P97929 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Brca2P97929 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Brca2P97929 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Brca2P97929 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Brca2P97929 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Brca2P97929 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Brca2P97929 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Brca2P97929 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Brca2P97929 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Brca2P97929 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Brca2P97929 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Brca2P97929 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Brca2P97929 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Brca2P97929 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Brca2P97929 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Brca2P97929 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Brca2P97929 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Brca2P97929 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Brca2P97929 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Brca2P97929 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Brca2P97929 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Brca2P97929 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Brca2P97929 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Brca2P97929 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Brca2P97929 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Brca2P97929 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Brca2P97929 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Brca2P97929 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Brca2P97929 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Brca2P97929 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,08■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Brca2P97929 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Brca2P97929 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Brca2P97929 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Brca2P97929 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Brca2P97929 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Brca2P97929 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Brca2P97929 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Brca2P97929 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Brca2P97929 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Brca2P97929 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Brca2P97929 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Brca2P97929 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Brca2P97929 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Brca2P97929 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Brca2P97929 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Brca2P97929 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Brca2P97929 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Brca2P97929 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Brca2P97929 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Brca2P97929 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Brca2P97929 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Brca2P97929 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Brca2P97929 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Brca2P97929 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Brca2P97929 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Brca2P97929 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Brca2P97929 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Brca2P97929 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Brca2P97929 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Brca2P97929 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Brca2P97929 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms