Protein–RNA interactions for Protein: P97304

Polr1d, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1dP97304 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1dP97304 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1dP97304 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1dP97304 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1dP97304 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1dP97304 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1dP97304 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1dP97304 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1dP97304 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1dP97304 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1dP97304 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1dP97304 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1dP97304 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1dP97304 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1dP97304 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1dP97304 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1dP97304 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1dP97304 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1dP97304 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1dP97304 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1dP97304 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1dP97304 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1dP97304 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1dP97304 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1dP97304 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1dP97304 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1dP97304 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1dP97304 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1dP97304 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1dP97304 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1dP97304 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1dP97304 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1dP97304 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1dP97304 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr1dP97304 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1dP97304 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1dP97304 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1dP97304 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1dP97304 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1dP97304 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1dP97304 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1dP97304 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1dP97304 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1dP97304 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1dP97304 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1dP97304 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1dP97304 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1dP97304 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1dP97304 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1dP97304 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1dP97304 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1dP97304 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1dP97304 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1dP97304 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1dP97304 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1dP97304 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1dP97304 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1dP97304 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1dP97304 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1dP97304 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1dP97304 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1dP97304 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1dP97304 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1dP97304 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms