Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gabpb2P81069 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gabpb2P81069 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gabpb2P81069 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gabpb2P81069 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gabpb2P81069 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gabpb2P81069 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gabpb2P81069 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gabpb2P81069 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gabpb2P81069 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Gabpb2P81069 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gabpb2P81069 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gabpb2P81069 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gabpb2P81069 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Gabpb2P81069 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gabpb2P81069 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gabpb2P81069 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gabpb2P81069 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gabpb2P81069 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gabpb2P81069 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gabpb2P81069 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gabpb2P81069 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gabpb2P81069 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gabpb2P81069 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gabpb2P81069 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gabpb2P81069 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gabpb2P81069 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gabpb2P81069 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gabpb2P81069 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gabpb2P81069 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Gabpb2P81069 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gabpb2P81069 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gabpb2P81069 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gabpb2P81069 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gabpb2P81069 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gabpb2P81069 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gabpb2P81069 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gabpb2P81069 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gabpb2P81069 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gabpb2P81069 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gabpb2P81069 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gabpb2P81069 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gabpb2P81069 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gabpb2P81069 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gabpb2P81069 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gabpb2P81069 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Gabpb2P81069 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gabpb2P81069 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gabpb2P81069 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gabpb2P81069 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gabpb2P81069 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gabpb2P81069 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gabpb2P81069 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gabpb2P81069 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gabpb2P81069 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gabpb2P81069 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gabpb2P81069 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gabpb2P81069 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gabpb2P81069 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gabpb2P81069 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gabpb2P81069 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gabpb2P81069 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gabpb2P81069 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gabpb2P81069 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gabpb2P81069 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gabpb2P81069 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gabpb2P81069 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gabpb2P81069 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gabpb2P81069 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gabpb2P81069 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gabpb2P81069 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gabpb2P81069 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms