Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr1bP70700 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr1bP70700 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr1bP70700 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1bP70700 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr1bP70700 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1bP70700 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr1bP70700 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr1bP70700 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr1bP70700 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1bP70700 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1bP70700 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1bP70700 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1bP70700 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1bP70700 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1bP70700 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Polr1bP70700 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr1bP70700 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr1bP70700 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr1bP70700 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr1bP70700 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr1bP70700 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr1bP70700 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr1bP70700 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr1bP70700 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr1bP70700 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr1bP70700 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1bP70700 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1bP70700 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr1bP70700 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr1bP70700 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1bP70700 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr1bP70700 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr1bP70700 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1bP70700 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr1bP70700 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1bP70700 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1bP70700 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1bP70700 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1bP70700 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1bP70700 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1bP70700 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr1bP70700 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr1bP70700 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Polr1bP70700 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr1bP70700 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1bP70700 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr1bP70700 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1bP70700 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr1bP70700 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr1bP70700 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr1bP70700 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr1bP70700 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1bP70700 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr1bP70700 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr1bP70700 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms