Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tuba1cP68373 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tuba1cP68373 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tuba1cP68373 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tuba1cP68373 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tuba1cP68373 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tuba1cP68373 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tuba1cP68373 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tuba1cP68373 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tuba1cP68373 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tuba1cP68373 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tuba1cP68373 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tuba1cP68373 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tuba1cP68373 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tuba1cP68373 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tuba1cP68373 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tuba1cP68373 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tuba1cP68373 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tuba1cP68373 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tuba1cP68373 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tuba1cP68373 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tuba1cP68373 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tuba1cP68373 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tuba1cP68373 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tuba1cP68373 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tuba1cP68373 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tuba1cP68373 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tuba1cP68373 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tuba1cP68373 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tuba1cP68373 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tuba1cP68373 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tuba1cP68373 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tuba1cP68373 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tuba1cP68373 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tuba1cP68373 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tuba1cP68373 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tuba1cP68373 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tuba1cP68373 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tuba1cP68373 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tuba1cP68373 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tuba1cP68373 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tuba1cP68373 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tuba1cP68373 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tuba1cP68373 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tuba1cP68373 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tuba1cP68373 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tuba1cP68373 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tuba1cP68373 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tuba1cP68373 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tuba1cP68373 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tuba1cP68373 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tuba1cP68373 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tuba1cP68373 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tuba1cP68373 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tuba1cP68373 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tuba1cP68373 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tuba1cP68373 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tuba1cP68373 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tuba1cP68373 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tuba1cP68373 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba1cP68373 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba1cP68373 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba1cP68373 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tuba1cP68373 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tuba1cP68373 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tuba1cP68373 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tuba1cP68373 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tuba1cP68373 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tuba1cP68373 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tuba1cP68373 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tuba1cP68373 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tuba1cP68373 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tuba1cP68373 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tuba1cP68373 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tuba1cP68373 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba1cP68373 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba1cP68373 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms