Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp2P63044 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vamp2P63044 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp2P63044 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp2P63044 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vamp2P63044 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vamp2P63044 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp2P63044 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp2P63044 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vamp2P63044 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vamp2P63044 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vamp2P63044 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp2P63044 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp2P63044 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vamp2P63044 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp2P63044 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp2P63044 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp2P63044 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vamp2P63044 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp2P63044 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vamp2P63044 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp2P63044 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp2P63044 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp2P63044 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp2P63044 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp2P63044 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp2P63044 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vamp2P63044 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp2P63044 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp2P63044 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp2P63044 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp2P63044 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp2P63044 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp2P63044 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp2P63044 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp2P63044 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp2P63044 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp2P63044 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vamp2P63044 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp2P63044 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp2P63044 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vamp2P63044 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp2P63044 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp2P63044 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp2P63044 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp2P63044 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp2P63044 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp2P63044 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp2P63044 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp2P63044 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp2P63044 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp2P63044 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp2P63044 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp2P63044 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp2P63044 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp2P63044 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp2P63044 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp2P63044 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp2P63044 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp2P63044 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp2P63044 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp2P63044 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp2P63044 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp2P63044 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vamp2P63044 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vamp2P63044 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vamp2P63044 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp2P63044 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp2P63044 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp2P63044 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp2P63044 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms