Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrx1P63013 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrx1P63013 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrx1P63013 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrx1P63013 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrx1P63013 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrx1P63013 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrx1P63013 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrx1P63013 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrx1P63013 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrx1P63013 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrx1P63013 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrx1P63013 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrx1P63013 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrx1P63013 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrx1P63013 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrx1P63013 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrx1P63013 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrx1P63013 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrx1P63013 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrx1P63013 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrx1P63013 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrx1P63013 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrx1P63013 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrx1P63013 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrx1P63013 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrx1P63013 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrx1P63013 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrx1P63013 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrx1P63013 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prrx1P63013 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrx1P63013 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrx1P63013 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrx1P63013 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrx1P63013 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrx1P63013 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrx1P63013 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrx1P63013 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prrx1P63013 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrx1P63013 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrx1P63013 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrx1P63013 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrx1P63013 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrx1P63013 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrx1P63013 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrx1P63013 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrx1P63013 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrx1P63013 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrx1P63013 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrx1P63013 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrx1P63013 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrx1P63013 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrx1P63013 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrx1P63013 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrx1P63013 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrx1P63013 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrx1P63013 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrx1P63013 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrx1P63013 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrx1P63013 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrx1P63013 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrx1P63013 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrx1P63013 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrx1P63013 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrx1P63013 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrx1P63013 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms