Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Pfn1P62962 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Pfn1P62962 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Pfn1P62962 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Pfn1P62962 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Pfn1P62962 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Pfn1P62962 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Pfn1P62962 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Pfn1P62962 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Pfn1P62962 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Pfn1P62962 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Pfn1P62962 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Pfn1P62962 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Pfn1P62962 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Pfn1P62962 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Pfn1P62962 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Pfn1P62962 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Pfn1P62962 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Pfn1P62962 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Pfn1P62962 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Pfn1P62962 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Pfn1P62962 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Pfn1P62962 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,77■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Pfn1P62962 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,64■□□□□ 0,9
Pfn1P62962 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Pfn1P62962 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Pfn1P62962 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Pfn1P62962 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Pfn1P62962 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Pfn1P62962 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,57■□□□□ 0,88
Pfn1P62962 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Pfn1P62962 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Pfn1P62962 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Pfn1P62962 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,54■□□□□ 0,88
Pfn1P62962 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Pfn1P62962 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Pfn1P62962 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Pfn1P62962 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Pfn1P62962 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,33■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,29■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Pfn1P62962 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Pfn1P62962 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Pfn1P62962 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Pfn1P62962 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms