Protein–RNA interactions for Protein: P62482

Kcnab2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab2P62482 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnab2P62482 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnab2P62482 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnab2P62482 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnab2P62482 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnab2P62482 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnab2P62482 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnab2P62482 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnab2P62482 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnab2P62482 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnab2P62482 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnab2P62482 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnab2P62482 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnab2P62482 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnab2P62482 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnab2P62482 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnab2P62482 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnab2P62482 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnab2P62482 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnab2P62482 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnab2P62482 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnab2P62482 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnab2P62482 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnab2P62482 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnab2P62482 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnab2P62482 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnab2P62482 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnab2P62482 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcnab2P62482 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnab2P62482 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnab2P62482 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnab2P62482 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnab2P62482 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnab2P62482 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnab2P62482 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnab2P62482 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnab2P62482 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnab2P62482 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnab2P62482 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnab2P62482 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnab2P62482 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnab2P62482 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnab2P62482 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnab2P62482 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnab2P62482 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnab2P62482 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnab2P62482 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnab2P62482 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kcnab2P62482 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnab2P62482 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnab2P62482 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnab2P62482 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnab2P62482 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnab2P62482 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnab2P62482 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnab2P62482 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnab2P62482 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnab2P62482 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnab2P62482 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Kcnab2P62482 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnab2P62482 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnab2P62482 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnab2P62482 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnab2P62482 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnab2P62482 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnab2P62482 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnab2P62482 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnab2P62482 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnab2P62482 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnab2P62482 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnab2P62482 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnab2P62482 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnab2P62482 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnab2P62482 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnab2P62482 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnab2P62482 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnab2P62482 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnab2P62482 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnab2P62482 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms