Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan5P62080 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan5P62080 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan5P62080 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tspan5P62080 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan5P62080 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan5P62080 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan5P62080 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan5P62080 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan5P62080 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan5P62080 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan5P62080 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan5P62080 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan5P62080 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan5P62080 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan5P62080 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan5P62080 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan5P62080 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan5P62080 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan5P62080 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan5P62080 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan5P62080 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan5P62080 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan5P62080 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan5P62080 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan5P62080 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan5P62080 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan5P62080 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan5P62080 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan5P62080 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan5P62080 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan5P62080 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan5P62080 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan5P62080 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan5P62080 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan5P62080 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan5P62080 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan5P62080 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan5P62080 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan5P62080 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan5P62080 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan5P62080 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan5P62080 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan5P62080 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan5P62080 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan5P62080 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan5P62080 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan5P62080 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tspan5P62080 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan5P62080 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan5P62080 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan5P62080 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan5P62080 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan5P62080 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tspan5P62080 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan5P62080 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms