Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copz1P61924 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copz1P61924 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copz1P61924 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Copz1P61924 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copz1P61924 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copz1P61924 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copz1P61924 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copz1P61924 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copz1P61924 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copz1P61924 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copz1P61924 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copz1P61924 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Copz1P61924 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copz1P61924 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Copz1P61924 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copz1P61924 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copz1P61924 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copz1P61924 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copz1P61924 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copz1P61924 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Copz1P61924 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Copz1P61924 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copz1P61924 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copz1P61924 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copz1P61924 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copz1P61924 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copz1P61924 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copz1P61924 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copz1P61924 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copz1P61924 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Copz1P61924 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copz1P61924 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copz1P61924 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copz1P61924 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copz1P61924 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copz1P61924 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copz1P61924 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copz1P61924 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copz1P61924 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copz1P61924 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copz1P61924 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Copz1P61924 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Copz1P61924 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copz1P61924 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copz1P61924 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copz1P61924 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copz1P61924 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copz1P61924 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copz1P61924 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Copz1P61924 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copz1P61924 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Copz1P61924 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copz1P61924 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copz1P61924 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copz1P61924 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copz1P61924 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copz1P61924 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copz1P61924 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copz1P61924 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copz1P61924 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copz1P61924 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copz1P61924 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copz1P61924 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copz1P61924 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copz1P61924 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Copz1P61924 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copz1P61924 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copz1P61924 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copz1P61924 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Copz1P61924 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Copz1P61924 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copz1P61924 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Copz1P61924 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms