Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf13P61216 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf13P61216 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf13P61216 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf13P61216 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf13P61216 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf13P61216 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf13P61216 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf13P61216 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf13P61216 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf13P61216 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf13P61216 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf13P61216 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf13P61216 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf13P61216 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf13P61216 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf13P61216 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf13P61216 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf13P61216 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf13P61216 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf13P61216 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf13P61216 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf13P61216 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf13P61216 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf13P61216 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf13P61216 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf13P61216 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf13P61216 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf13P61216 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf13P61216 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf13P61216 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf13P61216 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf13P61216 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf13P61216 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf13P61216 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf13P61216 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf13P61216 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf13P61216 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf13P61216 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf13P61216 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf13P61216 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf13P61216 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf13P61216 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf13P61216 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf13P61216 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf13P61216 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf13P61216 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf13P61216 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf13P61216 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf13P61216 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf13P61216 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf13P61216 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf13P61216 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf13P61216 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf13P61216 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf13P61216 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf13P61216 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf13P61216 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf13P61216 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf13P61216 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf13P61216 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf13P61216 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf13P61216 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf13P61216 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf13P61216 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf13P61216 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf13P61216 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms