Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem258P61166 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem258P61166 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem258P61166 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem258P61166 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem258P61166 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem258P61166 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem258P61166 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem258P61166 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem258P61166 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem258P61166 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem258P61166 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem258P61166 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem258P61166 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem258P61166 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem258P61166 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem258P61166 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem258P61166 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem258P61166 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem258P61166 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem258P61166 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem258P61166 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem258P61166 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem258P61166 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem258P61166 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms