Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab8bP61028 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab8bP61028 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab8bP61028 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab8bP61028 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab8bP61028 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab8bP61028 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab8bP61028 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab8bP61028 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab8bP61028 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab8bP61028 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab8bP61028 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab8bP61028 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab8bP61028 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab8bP61028 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab8bP61028 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab8bP61028 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab8bP61028 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab8bP61028 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab8bP61028 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab8bP61028 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab8bP61028 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab8bP61028 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab8bP61028 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab8bP61028 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab8bP61028 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab8bP61028 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab8bP61028 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab8bP61028 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab8bP61028 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab8bP61028 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab8bP61028 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab8bP61028 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab8bP61028 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab8bP61028 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab8bP61028 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab8bP61028 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab8bP61028 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab8bP61028 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab8bP61028 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab8bP61028 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab8bP61028 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab8bP61028 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab8bP61028 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab8bP61028 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab8bP61028 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab8bP61028 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab8bP61028 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab8bP61028 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rab8bP61028 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab8bP61028 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab8bP61028 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab8bP61028 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab8bP61028 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab8bP61028 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab8bP61028 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab8bP61028 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab8bP61028 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab8bP61028 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab8bP61028 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab8bP61028 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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