Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ActbP60710 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ActbP60710 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ActbP60710 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ActbP60710 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ActbP60710 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ActbP60710 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ActbP60710 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ActbP60710 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ActbP60710 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ActbP60710 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ActbP60710 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ActbP60710 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ActbP60710 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ActbP60710 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ActbP60710 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ActbP60710 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ActbP60710 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ActbP60710 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ActbP60710 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ActbP60710 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ActbP60710 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ActbP60710 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ActbP60710 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ActbP60710 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ActbP60710 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ActbP60710 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ActbP60710 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ActbP60710 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ActbP60710 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ActbP60710 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ActbP60710 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ActbP60710 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ActbP60710 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ActbP60710 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ActbP60710 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ActbP60710 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ActbP60710 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ActbP60710 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ActbP60710 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ActbP60710 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ActbP60710 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ActbP60710 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ActbP60710 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ActbP60710 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ActbP60710 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ActbP60710 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ActbP60710 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ActbP60710 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ActbP60710 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ActbP60710 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ActbP60710 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ActbP60710 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ActbP60710 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ActbP60710 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ActbP60710 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ActbP60710 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ActbP60710 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ActbP60710 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ActbP60710 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ActbP60710 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ActbP60710 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ActbP60710 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ActbP60710 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ActbP60710 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ActbP60710 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ActbP60710 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ActbP60710 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ActbP60710 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ActbP60710 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ActbP60710 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ActbP60710 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ActbP60710 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ActbP60710 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ActbP60710 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ActbP60710 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ActbP60710 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ActbP60710 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ActbP60710 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ActbP60710 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ActbP60710 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ActbP60710 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ActbP60710 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ActbP60710 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ActbP60710 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ActbP60710 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ActbP60710 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ActbP60710 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ActbP60710 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ActbP60710 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ActbP60710 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ActbP60710 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ActbP60710 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ActbP60710 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ActbP60710 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ActbP60710 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ActbP60710 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ActbP60710 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ActbP60710 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ActbP60710 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms