Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Ppfia3P60469 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Ppfia3P60469 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Ppfia3P60469 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Ppfia3P60469 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Ppfia3P60469 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Ppfia3P60469 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Ppfia3P60469 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Ppfia3P60469 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Ppfia3P60469 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Ppfia3P60469 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Ppfia3P60469 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Ppfia3P60469 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Ppfia3P60469 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Ppfia3P60469 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Ppfia3P60469 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Ppfia3P60469 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ppfia3P60469 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ppfia3P60469 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Ppfia3P60469 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ppfia3P60469 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Ppfia3P60469 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Ppfia3P60469 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Ppfia3P60469 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Ppfia3P60469 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Ppfia3P60469 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Ppfia3P60469 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Ppfia3P60469 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Ppfia3P60469 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Ppfia3P60469 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Ppfia3P60469 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,65■■■□□ 2,66
Ppfia3P60469 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Ppfia3P60469 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Ppfia3P60469 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Ppfia3P60469 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ppfia3P60469 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ppfia3P60469 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Ppfia3P60469 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Ppfia3P60469 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Ppfia3P60469 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Ppfia3P60469 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Ppfia3P60469 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Ppfia3P60469 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Ppfia3P60469 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Ppfia3P60469 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Ppfia3P60469 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Ppfia3P60469 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Ppfia3P60469 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ppfia3P60469 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ppfia3P60469 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ppfia3P60469 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Ppfia3P60469 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Ppfia3P60469 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Ppfia3P60469 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,22■■■□□ 2,59
Ppfia3P60469 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Ppfia3P60469 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ppfia3P60469 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Ppfia3P60469 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ppfia3P60469 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Ppfia3P60469 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Ppfia3P60469 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Ppfia3P60469 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Ppfia3P60469 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Ppfia3P60469 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Ppfia3P60469 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ppfia3P60469 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Ppfia3P60469 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ppfia3P60469 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Ppfia3P60469 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Ppfia3P60469 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Ppfia3P60469 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ppfia3P60469 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Ppfia3P60469 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ppfia3P60469 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ppfia3P60469 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Ppfia3P60469 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,53
Ppfia3P60469 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ppfia3P60469 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ppfia3P60469 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Ppfia3P60469 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Ppfia3P60469 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Ppfia3P60469 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Ppfia3P60469 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Ppfia3P60469 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Ppfia3P60469 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Ppfia3P60469 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Ppfia3P60469 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ppfia3P60469 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ppfia3P60469 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Ppfia3P60469 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Ppfia3P60469 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Ppfia3P60469 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ppfia3P60469 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,1 ms