Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Hps5P59438 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,14■■■□□ 2,57
Hps5P59438 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Hps5P59438 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Hps5P59438 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Hps5P59438 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Hps5P59438 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Hps5P59438 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Hps5P59438 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Hps5P59438 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Hps5P59438 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hps5P59438 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Hps5P59438 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Hps5P59438 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Hps5P59438 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Hps5P59438 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Hps5P59438 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Hps5P59438 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Hps5P59438 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,52
Hps5P59438 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Hps5P59438 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Hps5P59438 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Hps5P59438 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Hps5P59438 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Hps5P59438 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Hps5P59438 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Hps5P59438 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Hps5P59438 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Hps5P59438 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Hps5P59438 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Hps5P59438 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Hps5P59438 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Hps5P59438 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Hps5P59438 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Hps5P59438 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
Hps5P59438 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Hps5P59438 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Hps5P59438 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Hps5P59438 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Hps5P59438 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Hps5P59438 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hps5P59438 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hps5P59438 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Hps5P59438 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Hps5P59438 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Hps5P59438 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
Hps5P59438 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Hps5P59438 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Hps5P59438 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Hps5P59438 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Hps5P59438 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Hps5P59438 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Hps5P59438 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Hps5P59438 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Hps5P59438 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Hps5P59438 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Hps5P59438 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Hps5P59438 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Hps5P59438 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Hps5P59438 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Hps5P59438 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Hps5P59438 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Hps5P59438 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hps5P59438 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Hps5P59438 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Hps5P59438 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Hps5P59438 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Hps5P59438 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Hps5P59438 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Hps5P59438 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Hps5P59438 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Hps5P59438 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Hps5P59438 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Hps5P59438 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Hps5P59438 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Hps5P59438 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Hps5P59438 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Hps5P59438 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Hps5P59438 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Hps5P59438 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Hps5P59438 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Hps5P59438 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Hps5P59438 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Hps5P59438 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Hps5P59438 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Hps5P59438 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Hps5P59438 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Hps5P59438 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Hps5P59438 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Hps5P59438 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Hps5P59438 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Hps5P59438 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Hps5P59438 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,4 ms