Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Tlr7P58681 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tlr7P58681 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tlr7P58681 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Tlr7P58681 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tlr7P58681 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tlr7P58681 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tlr7P58681 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tlr7P58681 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tlr7P58681 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tlr7P58681 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Tlr7P58681 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tlr7P58681 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tlr7P58681 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tlr7P58681 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tlr7P58681 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tlr7P58681 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tlr7P58681 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tlr7P58681 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tlr7P58681 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Tlr7P58681 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Tlr7P58681 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tlr7P58681 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tlr7P58681 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tlr7P58681 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tlr7P58681 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tlr7P58681 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tlr7P58681 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tlr7P58681 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tlr7P58681 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Tlr7P58681 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tlr7P58681 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tlr7P58681 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tlr7P58681 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tlr7P58681 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tlr7P58681 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tlr7P58681 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tlr7P58681 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tlr7P58681 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tlr7P58681 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Tlr7P58681 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tlr7P58681 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Tlr7P58681 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tlr7P58681 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tlr7P58681 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Tlr7P58681 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Tlr7P58681 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Tlr7P58681 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Tlr7P58681 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tlr7P58681 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Tlr7P58681 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Tlr7P58681 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tlr7P58681 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tlr7P58681 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tlr7P58681 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tlr7P58681 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tlr7P58681 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tlr7P58681 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tlr7P58681 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tlr7P58681 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tlr7P58681 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tlr7P58681 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tlr7P58681 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Tlr7P58681 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tlr7P58681 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tlr7P58681 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tlr7P58681 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tlr7P58681 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tlr7P58681 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Tlr7P58681 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tlr7P58681 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tlr7P58681 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tlr7P58681 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Tlr7P58681 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tlr7P58681 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tlr7P58681 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tlr7P58681 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tlr7P58681 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tlr7P58681 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tlr7P58681 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tlr7P58681 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tlr7P58681 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tlr7P58681 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tlr7P58681 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tlr7P58681 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tlr7P58681 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tlr7P58681 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tlr7P58681 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms