Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Paxbp1P58501 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Paxbp1P58501 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Paxbp1P58501 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Paxbp1P58501 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
Paxbp1P58501 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Paxbp1P58501 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Paxbp1P58501 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Paxbp1P58501 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Paxbp1P58501 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Paxbp1P58501 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Paxbp1P58501 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Paxbp1P58501 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Paxbp1P58501 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Paxbp1P58501 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Paxbp1P58501 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Paxbp1P58501 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Paxbp1P58501 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Paxbp1P58501 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Paxbp1P58501 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Paxbp1P58501 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Paxbp1P58501 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Paxbp1P58501 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Paxbp1P58501 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Paxbp1P58501 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Paxbp1P58501 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Paxbp1P58501 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Paxbp1P58501 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Paxbp1P58501 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Paxbp1P58501 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Paxbp1P58501 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Paxbp1P58501 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Paxbp1P58501 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Paxbp1P58501 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Paxbp1P58501 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Paxbp1P58501 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Paxbp1P58501 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Paxbp1P58501 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Paxbp1P58501 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Paxbp1P58501 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Paxbp1P58501 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Paxbp1P58501 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Paxbp1P58501 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Paxbp1P58501 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Paxbp1P58501 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Paxbp1P58501 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Paxbp1P58501 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Paxbp1P58501 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Paxbp1P58501 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Paxbp1P58501 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Paxbp1P58501 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Paxbp1P58501 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Paxbp1P58501 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Paxbp1P58501 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Paxbp1P58501 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Paxbp1P58501 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Paxbp1P58501 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Paxbp1P58501 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Paxbp1P58501 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,64■■■□□ 2,33
Paxbp1P58501 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Paxbp1P58501 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Paxbp1P58501 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Paxbp1P58501 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Paxbp1P58501 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Paxbp1P58501 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Paxbp1P58501 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Paxbp1P58501 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Paxbp1P58501 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Paxbp1P58501 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Paxbp1P58501 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Paxbp1P58501 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Paxbp1P58501 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Paxbp1P58501 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Paxbp1P58501 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Paxbp1P58501 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Paxbp1P58501 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Paxbp1P58501 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Paxbp1P58501 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Paxbp1P58501 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Paxbp1P58501 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Paxbp1P58501 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Paxbp1P58501 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Paxbp1P58501 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Paxbp1P58501 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Paxbp1P58501 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Paxbp1P58501 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms