Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Paxbp1P58501 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Paxbp1P58501 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Paxbp1P58501 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Paxbp1P58501 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Paxbp1P58501 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Paxbp1P58501 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Paxbp1P58501 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Paxbp1P58501 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Paxbp1P58501 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Paxbp1P58501 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Paxbp1P58501 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Paxbp1P58501 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Paxbp1P58501 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Paxbp1P58501 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Paxbp1P58501 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Paxbp1P58501 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Paxbp1P58501 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Paxbp1P58501 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Paxbp1P58501 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Paxbp1P58501 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Paxbp1P58501 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Paxbp1P58501 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Paxbp1P58501 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Paxbp1P58501 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Paxbp1P58501 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Paxbp1P58501 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Paxbp1P58501 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Paxbp1P58501 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Paxbp1P58501 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Paxbp1P58501 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Paxbp1P58501 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Paxbp1P58501 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Paxbp1P58501 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Paxbp1P58501 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Paxbp1P58501 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Paxbp1P58501 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Paxbp1P58501 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Paxbp1P58501 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Paxbp1P58501 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Paxbp1P58501 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Paxbp1P58501 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Paxbp1P58501 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Paxbp1P58501 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Paxbp1P58501 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Paxbp1P58501 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Paxbp1P58501 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Paxbp1P58501 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Paxbp1P58501 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Paxbp1P58501 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Paxbp1P58501 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Paxbp1P58501 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Paxbp1P58501 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Paxbp1P58501 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Paxbp1P58501 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Paxbp1P58501 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Paxbp1P58501 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Paxbp1P58501 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Paxbp1P58501 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Paxbp1P58501 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Paxbp1P58501 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Paxbp1P58501 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Paxbp1P58501 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Paxbp1P58501 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Paxbp1P58501 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Paxbp1P58501 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Paxbp1P58501 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Paxbp1P58501 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Paxbp1P58501 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Paxbp1P58501 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Paxbp1P58501 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Paxbp1P58501 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Paxbp1P58501 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Paxbp1P58501 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paxbp1P58501 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Paxbp1P58501 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Paxbp1P58501 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Paxbp1P58501 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Paxbp1P58501 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Paxbp1P58501 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Paxbp1P58501 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Paxbp1P58501 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Paxbp1P58501 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Paxbp1P58501 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Paxbp1P58501 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Paxbp1P58501 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms